Ancient hybridization and strong adaptation to viruses across African vervet monkey populations
PBN-AR
Instytucja
Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk
Informacje podstawowe
Główny język publikacji
en
Czasopismo
NATURE GENETICS (50pkt w roku publikacji)
ISSN
1061-4036
EISSN
Wydawca
NATURE PUBLISHING GROUP
DOI
URL
Rok publikacji
2017
Numer zeszytu
12
Strony od-do
1705-1726
Numer tomu
49
Identyfikator DOI
Liczba arkuszy
Autorzy
(liczba autorów: 18)
Pozostali autorzy
+ 17
Słowa kluczowe
en
SIMIAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS
PROGRESSIVE MULTIFOCAL LEUKOENCEPHALOPATHY
GENETIC-VARIATION
SIV INFECTION
SOOTY MANGABEYS
RHESUS MACAQUES
HUMAN BRAIN
HISTORY
GENOMES
DNA
Streszczenia
Język
en
Treść
Vervet monkeys are among the most widely distributed nonhuman primates, show considerable phenotypic diversity, and have long been an important biomedical model for a variety of human diseases and in vaccine research. Using whole-genome sequencing data from 163 vervets sampled from across Africa and the Caribbean, we find high diversity within and between taxa and clear evidence that taxonomic divergence was reticulate rather than following a simple branching pattern. A scan for diversifying selection across taxa identifies strong and highly polygenic selection signals affecting viral processes. Furthermore, selection scores are elevated in genes whose human orthologs interact with HIV and in genes that show a response to experimental simian immunodeficiency virus (SIV) infection in vervet monkeys but not in rhesus macaques, suggesting that part of the signal reflects taxon-specific adaptation to SIV.
Inne
System-identifier
PX-5a37acbad5deffbb85fc9cfa
CrossrefMetadata from Crossref logo
Cytowania
Liczba prac cytujących tę pracę
Brak danych
Referencje
Liczba prac cytowanych przez tę pracę
Brak danych