Unnatural amino acids increase activity and specificity of synthetic substrates for human and malarial cathepsin C
PBN-AR
Instytucja
Wydział Chemiczny (Politechnika Wrocławska)
Informacje podstawowe
Główny język publikacji
eng
Czasopismo
AMINO ACIDS
ISSN
0939-4451
EISSN
Wydawca
DOI
URL
Rok publikacji
2014
Numer zeszytu
nr 4
Strony od-do
931-943
Numer tomu
vol. 46
Identyfikator DOI
Liczba arkuszy
Autorzy
Pozostali autorzy
+ 8
Słowa kluczowe
pol
substraty fluorogeniczne
specyficzność substratowa
proteazy cysteinowe
Open access
Tryb otwartego dostępu
Inne
Wersja tekstu w otwartym dostępie
Wersja opublikowana
Licencja otwartego dostępu
Creative Commons — Uznanie autorstwa
Czas opublikowania w otwartym dostępie
Razem z publikacją
Streszczenia
Język
eng
Treść
Mammalian cathepsin C is primarily responsible for the removal of N-terminal dipeptides and activation of several serine proteases in inflammatory or immune cells, while its malarial parasite ortholog dipeptidyl aminopeptidase 1 plays a crucial role in catabolizing the hemoglobin of its host erythrocyte. In this report, we describe the systematic substrate specificity analysis of three cathepsin C orthologs from Homo sapiens (human), Bos taurus (bovine) and Plasmodium falciparum (malaria parasite). Here, we present a new approach with a tailored fluorogenic substrate library designed and synthesized to probe the S1 and S2 pocket preferences of these enzymes with both natural and a broad range of unnatural amino acids. Our approach identified very efficiently hydrolyzed substrates containing unnatural amino acids, which resulted in the design of significantly better substrates than those previously known. Additionally, in this study significant differences in terms of the structures of optimal substrates for human and malarial orthologs are important from the therapeutic point of view. These data can be also used for the design of specific inhibitors or activity-based probes.
Inne
System-identifier
000192007
CrossrefMetadata from Crossref logo
Cytowania
Liczba prac cytujących tę pracę
Brak danych
Referencje
Liczba prac cytowanych przez tę pracę
Brak danych